После того, как в 1930 г. эта кафедра, как и все геологическое отделение МГУ со всеми его помещениями, лабораториями, музеями, библиотекой и пр. были выведены из Московского Университета и преобразованы в самостоятельный геолого-разведочный институт (МГРИ), в составе Почвенно-географического факультета МГУ усилиями одного из выдающихся учеников А.П. Павлова - профессора А.Н. Мазаровича практически на пустом месте была воссоздана кафедра геологии, сохранившая научные традиции Павловской школы и включившая в свой состав плеяду ее молодых питомцев - будущих известных ученых Г.П. Леонова. Г.Ф. Крашенинникова, Е.М. Великовской, М.М. Москвина, И.В. Лучицкого и др.

При возрождении геологического образования в МГУ сперва в рамках Геолого-почвенного, а позднее - самостоятельного Геологического факультета руководимая А.Н. Мазаровичем кафедра послужила ядром его геологического отделения и от нее последовательно ответвились кафедры палеонтологии, петрографии и минералогии, динамической геологии (в связи с чем она стала называться кафедрой исторической, а позднее - исторической и региональной геологии) и, наконец, - кафедра литологии. С 1951 г., после смерти А.Н. Мазаровича кафедру возглавил проф. А.А. Богданов, развернувший силами сотрудников и питомцев кафедры широкие регионально-геологические исследования в Казахстане, на Кавказе и других районах СССР, а после его кончины с 1972 г. по 2001 руководство кафедрой в течение почти 30 лет осуществлялось Е.Е. Милановским.

С 2002 года кафедру возглавляет проф. Анатолий Михайлович Никишин. В этот период на кафедре были внедрены компьютерные технологии и программирование в геологии, компьютерное моделирование. В последние годы в фундаментальных исследованиях по региональной геологии и тектонике широко стали использоваться результаты интерпретации данных сейсморазведки.

Свое настоящее название кафедра региональной геологии и истории Земли получила в конце 2000 г. Это название означает, что основным объектом научных исследований и педагогической деятельности сотрудников кафедры является изучение геологического строения континентов и океанов и, в первую очередь, территории России, с целью воссоздания геологической истории нашей планеты и выявления закономерностей этого процесса.